Matchen var helt jämn efter två perioder, innan Enköping avgjorde.
Segern var Enköpings femte på de senaste sex matcherna.
Målgörare för Enköping blev Daniel Andersson, Robin Nilsson, Niklas Rigelius och Ludvig Wallin och för Nyköping var det Daniel Bergqvist som hittade rätt.
Enköping stannar därmed på tredje plats, och Nyköping på nionde plats, i tabellen.
I nästa omgång har Enköping Huddinge IK borta i Björkängshallen, fredag 4 december 19.00.