David Norrström gjorde två mål och Filip Edlund ett mål för Vattholma, målen för Skuttunge gjordes av Ibrahim Jusu och Henrik Olsson.
Vattholma ligger på sjätte plats i tabellen efter matchen, medan Skuttunge är på tionde plats.
Nästa motstånd för Vattholma är Brottby. Lagen möts tisdag 13 augusti 19.00 på Änglavallen.