Bortalaget FC Gute hade ledningen i halvtid, med 1-0, men efter pausen vände IFK Uppsala matchen och vann till slut med 4-2.
Resultatet innebär sjunde matchen i rad utan förlust för IFK Uppsala.
Daniel Aramesh, Filip Cekol, Josef Jalil och Emrik Persson Engström gjorde hemmalagets mål, medan Tufve Östlund gjorde båda målen för bortalaget.
IFK Uppsala har tre segrar och två oavgjorda på de senaste fem matcherna, medan FC Gute har två vinster och tre förluster.
För tabellens utseende betyder det här att IFK Uppsala ligger på femte plats medan FC Gute har niondeplatsen.
I nästa match möter IFK Uppsala Stocksund borta på söndag 29 maj 16.00.