Övriga mål för hemmalaget gjordes av Kakra Boakye-Mensa, Willy Wickman och Linus Zetterström, enda målskytt för Viggbyholm blev Calle Ringström.
Segern var Enköping SK:s femte på de senaste sex matcherna.
Enköping SK har fyra segrar och en förlust på de senaste fem matcherna, medan Viggbyholm har tre vinster, en oavgjord och en förlust.
Resultatet betyder att båda lagen har oförändrad position i tabellen, Enköping SK på fjärde plats och Viggbyholm på andra plats.
Enköping SK tar sig an Bollstanäs i nästa match borta lördag 13 augusti 14.00.