Segern var IFK Uppsalas fjärde på de senaste fem matcherna.
Kosret Abdullahizad och Daniel Michel gjorde målen för IFK Uppsala, medan Frederic Kayembe Ilolo nätade för Norrtälje.
Norrtälje har nio poäng och IFK Uppsala har tolv poäng efter fem omgångar.
I nästa omgång har IFK Uppsala Heby AIF hemma på Lötens IP, lördag 31 juli 14.00.