Viggbyholms målskyttar var Guled Hassan, Axel Macquart-Moulin och Max Sjölander, medan Godwin Odudu Ibong gjorde målet för Gamla Upsala.
Viggbyholm har fyra segrar och en oavgjord på de senaste fem matcherna, medan Gamla Upsala har två vinster, en oavgjord och två förluster.
Viggbyholm ligger på andra plats i tabellen efter matchen, medan Gamla Upsala ligger på sjunde plats.
I nästa match möter Gamla Upsala Bollstanäs hemma på fredag 20 maj 19.15.