Men efter paus hämtade BK30 ikapp underläget och säkrade en poäng, 2-2 (2-1).
Sofia Fors och Moa Mattsson gjorde hemmalagets mål, medan Ella Gunnarsson gjorde båda målen för bortalaget.
Med tre omgångar kvar är Gamla Upsala på femte plats i tabellen, och BK30 är på tredje plats.
Nästa motstånd för Gamla Upsala är Ljusdal. Lagen möts söndag 20 september 13.00 på Erik Hamréns plan.