Målgörare för IFK Uppsala var Filip Cekol 2 och Serhat Akay, medan målen för Stocksund gjordes av Jens Jakobsson 3, Anton Bylin, Ömür Pektas och Niklas Persson.
IFK Uppsala har en oavgjord fyra förluster på de senaste fem matcherna, medan Stocksund har tre vinster och två oavgjorda.
Resultatet betyder att båda lagen har oförändrad position i tabellen, IFK Uppsala på tionde plats och Stocksund på andra plats.
I nästa match möter IFK Uppsala FC Gute borta på söndag 25 september 13.00.