Hemmalagets mål gjordes av Oliver Edberg, Lukas Ejnarsson och Isac Sepulveda, medan bortalagets mål noterades på Elvis Mashilingi 2 och Troy Linnes.
Heby AIF har en seger, två oavgjorda och två förluster på de senaste fem matcherna, medan Märsta har fyra vinster och en oavgjord. Det här var Heby AIF:s tredje oavgjorda match den här säsongen.
Resultatet betyder att båda lagen har oförändrad position i tabellen, Heby AIF på sjätte plats och Märsta på andra plats.
I nästa match möter Heby AIF Unik hemma på söndag 7 augusti 13.00.