Det uppger fotbollförbundet i ett pressmeddelande.
Bergvall har redan lämnat truppen och Tallinn för att lägga fokus på sin rehabilitering.
18-åringen, som i somras lämnade Djurgården för Tottenham i Premier League, debuterade i landslaget i träningslandskampen mot Estland i januari. Med inhoppet mot Azerbajdzjan i september fick han göra sin tävlingsdebut.
Några dagar senare väntade ett nytt inhopp hemma mot Estland i Nations League.
Han deltog inte i fredagskvällens 2–2-match mot Slovakien i Bratislava.
Kvällens match mot Estland har avspark 20.45.