Problemet orsakar störningar för hela den tyska tågtrafiken, med stora förseningar som följd, rapporterar public service-bolaget ARD.
Felet påverkar all tågtrafik i delstaten Hessen, inklusive pendeltåg. Spårtrafiken till och från Frankfurts flygplats, den sjätte största i Europa, står också stilla.
Frankfurt är en av de största knutpunkterna för tåg i Europa och har enligt ARD drygt 1 200 avgångar per dag.
Exakt vad som orsakat felet är ännu oklart, likaså när det kan vara åtgärdat, men det statliga järnvägsbolaget Deutsche Bahn meddelar att "våra specialister arbetar i högtryck för att lösa problemet".