Avtalet som stod klart i tisdags förväntas möjliggöra ökad produktion av naturgas i Medelhavet.
– Jag tillkännager Libanons godkännande av den slutliga versionen som utarbetats av den amerikanska medlaren för att fastställa den södra maritima gränsen, säger presidenten i ett tv-sänt tal.
Israel och Libanon har formellt legat i krig sedan staten Israels grundande 1948. Bägge länderna har gjort anspråk på ett runt 860 kvadratkilometer stort område i Medelhavet.