Minister Reza Fatemi Amin lyckades inte få till tillräckligt med stöd för att undvika ett nederlag i en förtroendeomröstning i parlamentet i Teheran.162 ledamöter röstade för ett misstroende mot Amin, medan 102 röstade för att han skulle vara kvar vid söndagens omröstning.
Ministern har också anklagats för vanskötsel av industridepartementet.
Det var andra gången som industriministern ställdes inför en förtroendeomröstning i parlamentet över stegrande priser. Han klarade en tidigare omröstning i november.
Prisökningar och ekonomiska problem plågar Irans befolkning, och den ekonomiska pressen förstärks av omfattande internationella ekonomiska sanktioner som riktas mot landet bland annat på grund av Irans kärnenergiprogram.