Smittan, som vanligtvis sprids via kontaminerad jord eller vatten, tros ha sitt ursprung i grävarbeten som gjorts i närheten av apornas hägn, meddelar Hongkongs minister för kultur, sport och turism, Kevin Yeung. En teori är att apornas djurskötare hade smittad jord på sina skor.
– Vi är ledsna över att de nio aporna dog, säger Yeung på en presskonferens och lägger till att utbrottet inte utgör någon fara för människor.
Åtta av aporna hittades döda i djurparken, Hongkongs äldsta, i söndags. Ytterligare en apa dog på måndagen efter att ha uppvisat "ovanligt beteende".
Tre av aporna var bomullshuvudtamariner. De är små, trädlevande apor som räknas till världens mest utrotningshotade primater. Bland de döda fanns också en brazzas markatta, en vanlig ekorrapa och fyra sakiapor.