Felet påverkade sträckorna Uppsala-Stockholm city-Södertälje samt Märsta-Stockholm City-Nynäshamn, enligt Trafikverket.
Problemen började redan vid 13.30, men Trafikverket har inte kunnat ge några exakta besked om vad det är som strulat, och inte heller någon prognos om när det skulle vara avhjälpt. Det ska dock ha handlat om någon typ av signalfel.
- Jag kan inte spekulera i själva felet, men reparatörer är på plats och jobbar, sade Joanna Ljunggren, presskommunikatör på Trafikverket vid 19-tiden.
Men vid kl 21 på tisdagskvällen ska trafiken alltså till sist ha börjat rulla normalt igen.
- Vi vet fortfarande inte säkert vad det var för fel, säger Jesper Andersson, som tagit över tjänstgöringen vid Trafikverkets presstjänst.