Branden bröt ut på ovanvåningen i en företagslokal.
Räddningstjänsten larmades till platsen med elva enheter strax efter midnatt. De arbetade med stegar och försökte släcka branden ovanifrån.
– Det luktar över hela Uppsala, säger räddningsledningen under natten.
En bensinmack ligger i närheten av platsen, men elden spred sig aldrig och ingen person har kommit till skada. Företagslokalen har däremot totalskadats. Räddningstjänsten kunde först lämna platsen vid klockan 07 på fredagsmorgonen.
I närheten av branden låg en bensinmack, som dock klarade sig undan lågorna.
Polisen misstänker att branden är anlagd och en misstänkt gärningsperson, en man i 35-årsåldern, har gripits. Under fredagsmorgonen spärrades platsen av för en teknisk undersökning.
Samma företag som drabbats av branden har också fått bilar totalförstörda i två av de bränder som härjat på parkeringsplatser runt om i kommunen under natten.
Branden bröt ut på ovanvåningen och totalförstörde byggnaden.
– Vi utreder kopplingar mellan nattens bränder. Men personen är i första hand misstänkt för branden i lokalen, säger polisens presstalesperson Magnus Jansson Klarin.
Senare under förmiddagen anhölls mannen och ärendet hanteras nu av åklagare.
På fredagseftermiddagen började det åter ryka från byggnaden och räddningstjänsten larmades tillbaka för att kontrollera situationen. Larmet kom in vid klockan 14.30.
– Det är föremål under plåttaket som sporadiskt tar eld och orsakar viss rökutveckling. Vi är där och eftersläcker, och vi kanske åker dit fler gånger under kvällen och kontrollerar, sade Ludvig Sääf på räddningstjänsten.