Mannen, som är från Uppsala, döms för brottsrubriceringarna våldtäkt mot barn och grovt barnpornografibrott.
Förutom våldtäkterna hittade polisen närmare 10 000 filer innehållande barnpornografiskt material i mannens dator, material som han sedan spridit vidare till andra.
Straffet blir fängelse i fem år. Han ska även betala skadestånd på drygt 250 000 kronor vardera till de två målsäganden.