Enligt Storstockolms räddningscentral föll ett träd över elledningarna på sträckan mellan Uppsala och Knivsta vid Alsike och det började brinna.
- Vår trafikledning har meddelat att det troligen handlar om att åskan har slagit sönder trädet, säger Lars Hedström, presskommunikatör på Trafikverket vid 15.50-tiden.
Enligt honom började det då brinna i en elanläggning på platsen. Klockan 15.40 uppger räddningstjänsten att branden är släckt men att trädet fortfarande ligger kvar.
- Våra felavhjälpare är på plats för att fixa kontaktledningen, men de har bara hunnit påbörja jobbet. De måste kolla hur stor del av ledningen som är skadad och så måste den bytas ut, säger Lars Hedström.
SL hänvisar till alternativa resvägar på sin hemsida och SJ har ställt in vissa avgångar mellan Uppsala-Stockholm.
Klockan 17.08 meddelar Trafikverket via sin hemsida att ett av de två spåren är öppet och båda spåren beräknas vara öppna efter klockan 21. Reducerad trafik och förseningar är att vänta.