Enligt Trafikverket är det signalerna från bommarna vid järnvägsövergången på Vimpelgatan i Uppsala som inte kommer fram till trafikledningscentralen. Det innebär att tågen måste få en manuell klarsignal för att kunna passera, vilket skapar tågkö. Strax före klockan 8 på morgonen hade det lett till förseningar på upp till 40 minuter på sträckan mellan Stockholm och Uppsala.
Strax före klockan 9 meddelar Trafikverket att felet är avhjälpt och att tågtrafiken rullar normalt igen.