Mannen, som är i 30-årsåldern, ska ha våldtagit kvinnan i Märsta när hon sov en natt i november. Vid samma tillfälle ska han ha hotat henne.
Enligt åtalet ska han också tidigare under kvällen ha ofredat kvinnan genom att bland annat ha smekt henne på låret. Han ska också ha antastat en annan kvinna samma kväll.
Rättegången vid Attunda tingsrätt avslutades i tisdags och den femte februari kommer domen mot mannen.