Jämtlands fältartilleri stod för dagens saluter.
I eftermiddag kommer ceremonin att fortsätta i universitetsaulan, där 67 nya doktorer och 18 hedersdoktorer kommer att promoveras.
Under ceremonin kommer Kungliga Akademiska kapellet att spela och ytterligare kanonsalut kommer att avfyras i intervaller mellan cirka klockan 12.45 och 15.
Polisen har fått in ett antal samtal under morgonen i samband med smällarna. Enligt polisens presstalesperson Magnus Jansson Klarin var det väntat med tanke på den senaste tidens sprängdåd.
– Det har varit runt 5-8 samtal. Men det är faktiskt färre än jag hade väntat mig, med tanke på omständigheterna, säger han.
Högljudda kanonskott väckte Uppsalaborna vid sjutiden på morgonen.