Driftstoppet, som pågick mellan klockan 11 och 13 på tisdagen, innebar att det inte gick att få läkemedelsrecept utskrivet på apoteken runt om i Sverige.
När UNT pratade med e-hälsomyndighetens presstjänst vid strax efter klockan 11 på förmiddagen visste man inte vad felet orsakats av.
- Vi försöker just nu identifiera problemet, sa Eva Reimers, kommunikationschef på e-hälsomyndigheten.
För personer som var akut sjuka fanns det dock sätt att få ut medicin, trots datorstrulet.
- Dfinns nödrutiner om det handlar om akutfall. Då får läkaren och apoteket ha direktkontakt, säger Eva Reimers.
En läsare som UNT har talat med berättar att han på tisdagsförmiddagen nekades sin medicin när han besökte apoteket.
- De berättade att det var driftstörning, så det var bara att gå hem igen.
Eva Fernell är kommunikationsdirektör på Apoteket och hon såg allvarligt på det inträffade när UNT kontaktade henne på förmiddagen.
- Det som händer är att vi inte kommer åt kundernas personuppgifter, vilket gör att vi inte kan expediera dem. Det är ett stort problem och vi hoppas att det löser sig så snabbt som möjligt.
Har ni varit med om något liknande förut?
- För fem år sedan hade vi ett eget stopp.
Har du fått några reaktioner ifrån era apotek?
- Inte vad jag vet, än så länge är det bara media som hört av sig.
På Apoteksgruppen i Uppsala hade personal satt upp lappar med information om felet. När UNT besökte apoteket var det flera personer som får lämna butiken utan någon medicin.
- Det har inte varit jättemånga kunder här under tiden som felet har pågått, säger Baian Nasraldin på Apoteksgruppen och fortsätter:
- De kunder som har kommit in har vi sagt till att komma tillbaka senare. Tyvärr har vi inte kunnat säga någon exakt tid för vi vet inte själva när felet ska vara avhjälpt.
Baian Nasraldin berättar att kunderna har tagit beskedet bra. I ett fall har apoteket dock fått sätta in nödrutinerna.
- Är det akuta fall finns nödrutiner som gör att patienten kan få ut sin medicin trots allt.
Även på Apoteket i S:t Persgallerian var det flera kunder som inte kunde få ut sin medicin när UNT var på plats. Personal på Apoteket ville dock inte kommentera händelsen.