Olyckan inträffade på Svartbäcksgatan vid 00.40-tiden natten till fredag. Enligt polisen befann sig ingen passagerare ombord och chauffören klarade sig oskadd.
-Bussen ligger på ena sidan och de står just nu och dividerar om hur de ska bärga den. Vägen är avstängd i båda riktningar under tiden, sa Torbjörn Karlsson, vakthavande befäl vid polisen i Uppsala, vid 02.10.
Chauffören har uppgett för polisen att att bussens bakända på något sätt kom upp på en betongsugga intill vägen så att fordonet välte.
-Det är en byggnation precis bredvid där de har nallat lite av vägbanan så passagen är lite smalare än vanligt, säger Torbjörn Karlsson.
Polisen misstänker inget brott i samband med olyckan.
-Det rör sig om en olyckshändelse helt enkelt, säger Torbjörn Karlsson.
Räddningstjänsten har sanerat vägbanan från glassplitter och dylikt.
Vid 05-tiden var bärgningen avklarad och båda körfälten är öppna för trafik igen.