Samtalet kom till polisen klockan 03:48 och skadeläget är ännu oklart.
-Det var rätt så mycket blod på platsen, men det behöver inte betyda att det rör sig om allvarliga skador, säger länsvakthavande polisbefäl Lars Eskhult.
Mannen fördes med ambulans till sjukhus och polisen grep senare två personer som bodde på ett vandrarhem i närheten.
De två männen, en i 40-årsåldern och en i 25-årsåldern, ska tillhöra samma sällskap som den skadade mannen. Samtliga män härrör enligt polisen från Stockholmsområdet.
Enligt polisen har de tre hamnat i någon typ av konflikt under kvällen, men omständigheterna är oklara.
Vid 10-tiden på onsdagsförmiddagen hade männen ännu inte hörts.
- De var så påverkade när de kom in så vi har inte kunnat höra dem. De får sova ruset av sig först, säger Lisa Sannervik, Uppsalapolisens presstalesperson.