Olyckan inträffade på cykelvägen på Fålhagsleden i närheten av McDonalds vid 20-tiden på tisdagskvällen.
Kvinnan fördes i ambulans till Akademiska sjukhuset i Uppsala med oklara skador.
– Kvinnan är skadad men det är oklart hur allvarligt skadad hon är, säger Johan Sohlberg, befäl vid polisnes regionledningscentral.
Föraren är nu misstänkt för att ha korsat cykelbanan på ett otillåtet sätt, samt vållande av kroppsskada.
Skadeläget var senare på kvällen fortsatt oklart, men patrullen har kunnat prata med henne.
— Jag har ingen aning om skadeläget nu, men ingångsvärdena var att hon hade skadat ett ben, säger Torsten Hemlin, vakthavande befäl vid polisen.