Stoppet inträffade vid 12.30-tiden.
Obehöriga befann sig på spåret någonstans mellan Uppsala och Knivsta, meddelar Trafikverket.
Polis kallades till platsen och en halvtimme senare var trafiken igång igen.
Följdförseningar kan dock förekomma.
Nu är tågtrafiken igång igen
Det var totalstopp i tågtrafiken mellan Stockholm och Uppsala under en halvtimmes tid vid lunchtid på söndagen.
Så jobbar vi med nyheter