Vid 02.30-tiden under natten till fredag larmades polisen till en livsmedelsbutik på Kungsgatan.
En eller flera gärningsmän ska ha brutit sig in genom att krossa en ruta till lokalen.
- Det är tobaksvaror som har stulits, säger Christer Nordström, Uppsalapolisens talesperson..
Polisen har spärrat av brottsplatsen och kommer genomföra en teknisk undersökning under fredagen.