Larmet kom in strax före klockan 17. Enligt larmet ska något ha blivit påkört.
- Vi sökte igenom en sträcka på cirka två kilometer men kunde inte hitta något. Vi hittade ett rådjur som hade blivit påkört, men det hade inträffat på dagen, säger Kurt Jonsson, ledningsoperatör på Storstockholms räddningscentral.
Vid 18.30-tiden avslutades därför sökinsatsen och tågen fick klartecken att köra igen.
Stoppet, som varade i över en timme, orsakade större förseningar och flera inställda tåg på sträckan Uppsala-Tierp.
Trafikverket hänvisar resenärer som har frågor om sin resa till respektive trafikbolag.