Olyckan inträffade vid 09.51 på Arlandabanan i höjd med Odensala.
– Jag gissar att tåget inte ens behövde stanna, men jag kan inte säga helt säkert, säger Carina Skagerlind vid polisen.
Lodjuret dog och nu är det polisens uppgift att, enligt rutin, frakta djuret till Naturhistoriska riksmuseet. Lodjur ingår nämligen i det som kallas "statens vilt", ett antal sällsynta fågel- och däggdjur som ägs av staten och inte markägaren när de dör.
Polisen skriver vidare på sin hemsida att man är skyldig att rapportera till polisen om man hittar ett dött djur som ägs av staten.
Carina Skagerlind berättar att kollisioner mellan tåg och vilt inte är helt ovanliga.
– Men jag tycker att det kanske var lite ovanligt att köra på just ett lodjur, säger hon.