Bolaget menar att de omdirigeringar som gjorts av flygverksamheten på Arlanda har inneburit stora kostnader, som de inte kompenserats för.
De yrkar på 25 miljoner kronor i böter.
– Vi har skickat ett åläggande till Swedavia och begärt att de lämnar in synpunkter på anmälan samt vissa uppgifter, säger Alexander Albrecht, föredragande på Konkurrensverket, till Nyhetsbyrån Siren.