Den fortsatta skyddsjakten tillåts eftersom länsstyrelsen gjort bedömningen att skarvbeståndet i de två kolonier som finns längs Upplandskusten är tillräckligt stort för att arten ska bevaras.
Antalet skarvar och häckningar har minskat kraftigt de senaste åren, till största delen förklaras detta med att havsörnar har haft skarvarna som födoreserv. Det tillstånd som gavs för skyddsjakt av skarv i den del av Mälaren som hör till Uppsala län 2008 gäller fram till utgången av 2010. Det innebär att fiskare med yrkesfiskarlicens får jaga skarv med kulvapen inom 300 meter från fasta och rörliga fiskeredskap.
Inom fågelskyddsområden och närmare än 300 meter från boplatser för fiskgjuse eller havsörn får skyddsjakt inte ske. Det är uttryckligen förbjudet att göra ingrepp i skarvbon, som att picka sönder ägg eller täppa till porerna på äggen. Länsstyrelserna i Uppsala, Västmanland, Södermanland och Stockholm har tidigare samarbetat om utredningar av bestånd och beslut om tillstånd för skyddsjakt av skarv i Mälaren.
Den treåriga period som samarbetet och besluten omfattat går ut i och med år 2010. Nya kontakter länsstyrelserna emellan håller nu på att tas inför eventuella kommande beslut.