Personen som larmade räddningstjänsten sa att det var ett svartbrunt skum på bäcken. Räddningstjänsten har ännu inte kunnat hitta källan till utsläppet.
– Det är något skimmer på ytan. Vi försöker ta reda på vad det är för något, säger Marie Nordahl.
Runt 12:30 på söndagen la räddningstjänsten ut några länsar på vattnet.
– Det är så att det inte sprider sig vidare, säger Marie Nordahl.
En läns används för att städa upp och hindra spridning av till exempel oljespill i vatten.
Räddningstjänsten lämnade platsen en bit efter klockan 13 på söndagen. Då visste man från räddningstjänstens sida fortfarande inte vad det var för något i vattnet.
– Vi har lämnat över till Uppsala Vatten och miljö- och hälsa som ska kolla på det, säger Kurt Holm, ledningsoperatör på räddningstjänsten.
Uppsala Vatten, som ansvarar för dricksvattnet i bland annat Länna, har under söndagen stängt av vattenintaget till vattenverket från Långsjön.
"Som en försiktighetsåtgärd har vi stängt av vattenintaget från Långsjön till vattenverket. Dricksvatten överförs istället via överföringsledningen från Uppsala", skriver Uppsala Vatten på sin hemsida.
Händelsen ska nu utredas vidare av miljöförvaltningen i Uppsala, uppger Fredrik Hardt, kommunikatör i beredskap på Uppsala kommun.
– Oavsett vad som släppts ut ska det inte påverka dricksvattnet. Miljöförvaltningen går nu vidare med händelsen under måndagen, säger han.