Det rör sig om tre män i 50–55-årsåldern, varav två är hemmahörande i Västsverige och en i Stockholmsområdet. De greps tidigt på onsdagsmorgonen och anhölls senare under dagen.
Två av männen misstänks för grova folkrättsbrott begångna i Syrien mellan juli och september 2012. För den tredje mannen sträcker sig misstankarna till september 2013. Alla tre är enligt TT:s uppgifter tidigare ostraffade.
Insatsen har skett inom ramen för ett samarbete mellan svensk och tysk åklagare och polis med stöd av Europol och Eurojust.
Parallellt har fem personer har gripits i Tyskland. De misstänks enligt kammaråklagare och förundersökningsledare Ulrika Bentelius Egelrud för brott som "delvis" rör samma händelse som de svenska medborgarna misstänks för.
Den federala tyska åklagarmyndigheten uppger att de gripna i båda länderna misstänks ha ingått i en regimtrogen väpnad rörelse.
Man uppger vidare att samtliga misstänkta ska ha deltagit i ett våldsamt angrepp mot en fredlig regimkritisk demonstration i Yarmuk utanför huvudstaden Damaskus den 13 juli 2012.
Där ska de som nu gripits i Tyskland ha öppnat eld mot demonstranter, vilket ledde till att minst sex personer dödades. Huruvida de gripna i Sverige deltagit i dödandet framgår inte.