"Det är med bottenlös sorg som vi i går tog emot beskedet från polisen att många människor har dödats och flera har skadats i en skolskjutning i Örebro", säger Kristersson i ett pressmeddelande.
"Det som inte får hända har nu hänt. I dag flaggar vi på halv stång när hela Sverige samlas till stöd för de drabbade – och i sorg över det som har hänt".
Flaggorna kommer att vara på halv stång under onsdagen från klockan nio på morgonen.
Även hovet har meddelat att man flaggar på halv stång under onsdagen. Samtliga kungliga slott kommer att flagga på halv stång i dag, efter ett beslut av kungen.
Beslutet gäller flaggorna på Kungliga slottet i Stockholm, Drottningholms slott, Haga slott, Rosersbergs slott, Ulriksdals slott, Gripsholms slott, Strömsholms slott, Tullgarns slott och Rosendals slott.