Beslutet fattades efter lunch på tisdagen. Information om händelsen ska läggas ut på kommunens hemsida och sändas hem till föräldrar.
– Vi har öppet som vanligt i morgon och kommer att ha fortsatt polisnärvaro på skolan under morgondagen, säger Ulla Halling, rektor för årskurserna 7-9.
Under resten av veckan kommer polisen också att närvara på skolan, dock oklart hur mycket.
Tidigare under tisdagen skakades skolan av ett hot som upptäcktes kvällen innan och polisanmäldes. Det var ett anonymt hot mot "någon" på Heby skola på appen "Jodel" som togs på allvar av polisen.
– Polisen är här nu. De sade till oss att ta hotet på allvar, sade Ulla Halling till UNT på förmiddagen.
Hotet går ut på att någon på skolan ska dö innan veckans slut.
Redan på förmiddagen gick en del elever hem, flest från högstadiet.
UNT:s reporter Hans Lundgren var på skolan när hotet blivit känt.
– Det var lugn stämning. En del elever var till och med lite uppspelta, sade han.
Några föräldrar har också kommit och hämtat sina barn.
– Men de flesta eleverna är kvar, berättade Hans Lundgren.
Skolan bildade en krisgrupp på morgonen.
– Det här är jättejobbigt och drar igång en sådan apparat, uppgav Ulla Halling.
Efter tisdagens skoldag ska personalen samlas för att gå igenom vad som hänt.
Hur tycker du att ni klarat det här?
– Det är så att orosnivån kan höjas i en grupp, men alla har arbetat lugnt och metodiskt, säger Ulla Halling.
På Heby skola går barn från förskoleklass till och med årskurs nio.
Via appen "Jodel" har det på senare tid riktats flera hot som medfört att skolor har stängt, bland annat stängde Örebro universitet i måndags.