Problemet uppstod klockan 14.20 i Heby på fredagseftermiddagen och reparatör är på plats.
Enligt Trafikverkets hemsida påverkas bland annat tåg mellan Uppsala, Heby och Sala.
– Det är ett tåg i Heby som blivit stående för att det är strömlöst på grund av elfel. Eftersom vi har oväder på ingång så kan det röra sig om ett nerfallet träd eller liknande som orsakat problemet, säger Åsa Elm, presstjänst på Mälartåg.
Enligt Trafikverket väntas prognosen återupptas söndag klockan 05.00.
Tåget som blev stående blev evakuerats och ersättningsbussar sattes in.
Trafikverkets hemsida meddelar att resenärer hänvisas till sitt järnvägsbolag.