Räddningstjänsten har befunnit sig i området sedan midnatt, när larmet om en brand inkom.
– Det har brunnit tvärs över spåret och i ledningar. Det har även brunnit i ett bullerplank, säger Tobias Åkesson, ledningsbefäl på Räddningsregion Mitt.
På grund av explosionsrisk från gasflaskor i byggnaden stoppades tågtrafiken förbi Enköping under onsdagsmorgonen. Räddningstjänsten har lagt ut sprängmattor över gasflaskorna för att begränsa en eventuell explosion och på så sätt kunna släppa på tågtrafiken. Vid 10-tiden bedömdes risken för explosion som hävd. Samtidigt meddelade Trafikverket att tågtrafiken ska vara igång igen men att vissa avgångar kan vara fortsatt inställda under dagen.
SJ har under morgonen satt in ersättningsbussar längs sträckan Västerås-Stockholm.
– Vi räknar med att ersätta tågen mellan Västerås och Stockholm med buss åtminstone hela förmiddagen och troligtvis en bit in på eftermiddagen, säger Dan Olofsson på SJ:s pressjour.
Han uppmanar också den som kan att välja en alternativ resväg eller resesätt under onsdagen.
– Det finns inte tillräckligt med bussar till alla som reser med morgontrafiken, så om man kan jobba hemifrån eller resa på annat sätt så rekommenderar vi det, säger Dan Olofsson.
Räddningstjänsten kommer att vara på plats under minst 24 timmar att arbeta med att kyla ned området.
Polisen kommer att ta över när området är säkrat.
– Nu är det räddningstjänstens ärende, därefter tar vi vid, säger Ida Mattsson, befäl på polisens regionsledningscentral.
Det finns inga rapporter om personskador.