Båten som har ett blått kapell körde först mot Enköping men sågs sedan svänga i riktning mot Stockholm.
I båten ska tre ungdomar ha befunnit sig.
Polisen har inte upptagit något aktivt sökande efter båttjuvarna.
Inte heller har båtens ägare inkommit med en polisanmälan.
– Det var lite försmädligt, en person såg hur båten försvann bort, säger Linda Wideberg RLC-befäl hos Polismyndigheten.