Beslutet togs under torsdagens regeringssammanträde. Framöver blir Mattsson ny generaldirektör och myndighetschef för FOI, Totalförsvarets forskningsinstitut i Stockholm.
– I nuläget har vi inte fått reda på vem som kommer ersätta honom, säger Elnaz Alizadeh som är kommunikationschef på SVA.
Jens Mattsson har varit generaldirektör för SVA sedan 2012. Innan dess har 55-åringen bland annat varit verksam som avdelningschef vid Karolinska Institutet. 1989 utexaminerades han från Uppsala universitet 1989 och disputerade 1993 vid Sveriges Lantbruksuniversitet på en doktorsavhandling i mikrobiologi.
Jens Mattsson tillträder sin nya tjänst på FOI 12 augusti.