Personalen ombord beslutade att utrymma planet, som skulle avgå mot Köpenhamn vid 19-tiden.
– I samband med ombordstigningen hittades något utöver det vanliga, säger Peter Werring, pressansvarig på Swedavia.
Området runt planet spärrades av och polisen undersökte föremålet tillsammans med tullen.
Strax före 21-tiden kunde polisen konstatera att föremålet inte var farligt.
– Objektet är ofarligt och vi kommer att lämna platsen, uppger Nadya Norton, polisens presstalesperson.
Det är oklart vad det misstänkt farliga föremålet var. Polisen har inlett en förundersökning om flygplatssabotage.
Vid 22.20-tiden kunde planet till slut avgå från Arlanda.