Som titeln antyder spelas huvudrollen av en ninja, vilken man ska hjälpa träna upp genom att utföra en mängd uppdrag. Det kan handla om att hoppa trampolin eller öva slag på en sandsäck. Allt eftersom blir ninjan mer skicklig och i takt med det blir utmaningarna mer avancerade. Kontrollen sköts genom enkla fingerrörelser, och det finns en hel del kreativa lösningar under uppdragen.
Trots sitt simpla upplägg är ”Clumsy Ninja” trevligt att plocka upp i små doser.