Det anser EU-kommissionen i en inledande utredning som nu bollas över till nätjätten för svar.
Bland annat hävdas att de avgifter som Apple tar ut av andra utvecklare "går bortom vad som är strikt nödvändigt".
"Vi är fast beslutna att använda de tydliga och effektiva verktygen i DMA för att slutligen öppna upp verkliga möjligheter för innovatörer och konsumenter", säger inremarknadskommissionären Thierry Breton i ett uttalande.
Kommissionen har sedan tidigare i år flera utredningar på gång kring hur Apple och andra nätjättar agerar i enlighet med DMA. I värsta fall riskerar bolagen dryga böter på upp mot 10 procent av företagens globala omsättning.