Hotet skickades via ett sms till en person som är anställd på skolan. Det kom till polisens kännedom omkring 15 minuter senare, strax före klockan 14.
Skolan utrymdes och polisen sökte igenom lokalerna.
Skolan har tidigare bombhotats den 6 maj och den 27 maj och de hoten visade sig också vara tomma.
LÄS MER: Här får polisen in bombhotet
LÄS MER: Rektorn: "Det är en olustkänsla"LÄS MER: Polisen söker samband mellan bombhoten
Strax före klockan 15.30 uppgav Christer Nordström, Uppsalapolisens presstalesperson, att polisen lämnat skolan efter att de konstaterat att det inte fanns någon föremål på platsen.